期刊简介

               1981年创刊,中华医学会、河北医科大学主办。本刊原名国外医学呼吸系统分册,系医学科技期刊,中华医学会系列刊物之一。办刊宗旨:贯彻、执行国家的政策法规和规范标准,坚持理论与实践、普及与提高相结合的原则,促进国内、外学术交流。报道内容:介绍国内、外呼吸疾病的新动态、新成果、新技术和新经验。主要栏目:诊治指南、专家述评、专家共识、专家笔谈、论著、综述、继续教育、呼吸介入、研究报道、专题讲座、临床经验、病例分析、病例报告、病例讨论、呼吸读片等。读者对象:呼吸科、急诊科、ICU、小儿科、老年科、胸外科、微创治疗中心、睡眠中心、变态反应科的医师和护士,以及从事呼吸领域基础研究和临床研究的科技工作者。                

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  • 杂志名称:国际呼吸杂志
  • 主管单位:中华人民共和国卫生部
  • 主办单位:中华医学会 河北医科大学
  • 国际刊号:1673-436X
  • 国内刊号:13-1368/R
  • 出版周期:半月刊
期刊荣誉:河北省优秀期刊期刊收录:国家图书馆馆藏, 上海图书馆馆藏, 知网收录(中), 统计源核心期刊(中国科技论文核心期刊), 万方收录(中), 维普收录(中)
国际呼吸杂志2018年第11期

基于GEO肺纤维化合并肺气肿综合征芯片数据的生物信息学分析

郭慧;郝小燕;刘学军

关键词:肺纤维化合并肺气肿综合征, 差异表达基因, 生物信息学
摘要:目的 通过生物信息学的方法分析正常人和肺纤维化合并肺气肿综合征(CPFE)患者的差异基因,从分子水平上探讨CPFE可能的发病机制.方法 从GEO数据库下载正常人群和CPFE患者的芯片信息,通过GCBI在线实验室分析获得差异基因.利用DAVID数据库分析差异基因获得GO富集分析和KEGG信号通路富集分析的结果.利用STRING筛选出互相作用蛋白≥10个作为关键基因,再将关键基因信息导入Cytoscape软件中形成编码蛋白互相作用的网络图.结果 筛选获得了1 303个差异基因,其中表达上调的基因828个,表达下调的基因475个.GO富集分析表明差异基因主要参与了免疫反应、细胞外基质的组成、信号转导生物过程,KEGG信号通路富集分析主要包括了细胞因子受体相互作用通路、趋化因子信号转导通路、细胞黏附分子信号通路.筛选获得了16个关键基因,为CCR5、IGF1、CXCL12、APP、CCL5、GNB4、SDC1、APOE、GNAQ、FPR2、ISG15、CD2、VCAM1、CCND1、JAK1、CCNB1.其中上调的13个,下调的3个.结论 通过生物信息学分析可以获得CPFE的差异基因、关键基因、生物学过程和信号通路等信息,为探究CPFE的发病机制提供依据.